O Colégio Militar Dom Pedro II encontra-se subordinado m Diretoria de Ensino do CBMDF na estrutura organizacional.

O ensino ministrado no CMDP II encontra-se alinhado com os objetivos gerais definidos em legislação no que tange a educação de forma a proporcionar ao educando o pleno desenvolvimento de sua personalidade e da integração harmônica de sua formação intelectual, moral e física, dentro de uma adequada orientação educacional de respeito e culto m pátria, aos símbolos e valores nacionais, e ainda preparando-os para o pleno exercício da cidadania e do civismo.

Informações adicionais referentes ao colégio podem ser encontradas aqui.